1960 yılında İstanbul‘da doğdu. Liseyi 1977 yılında Haydarpaşa Lisesi’nde tamamladı. 1982 yılında İstanbul Teknik Üniversitesi Makine Mühendisliği’nden mezun oldu. Mezun olduğu yıl yüksek lisansa başlayan ve kısa süre sonra araştırma görevlisi olarak aynı üniversiteye atanan Zafer Gül, 1985 yılında MEB’in doktora bursunu kazanarak İngiltere’ye gitti.

Manchester Üniversitesi’nde doktorasını tamamlayıp yurda döndü ve 1994 yılında Marmara Üniversitesi Mühendislik Fakültesi’ne yardımcı doçent olarak atandı.

1997 yılında doçentliğe yükseltildi ve aynı fakültede yönetim kurulu üyeliğine seçildi. 2002 yılında Fullbright bursunun kazanarak ABD’ye gitti ve Ohio Eyalet Üniversitesi’nde ders verdi.

2004 yılında profesörlüğe atanan Zafer Gül, 2005 yılında Makine Mühendisliği bölüm başkanlığına getirildi ve 2009 yılında Üniversite Senatosu’na senatör olarak seçildi.

10 Haziran 2010 tarihinde yapılan rektörlük seçiminde 302 oy alarak üçüncü olan Prof.Dr.Gül, Cumhurbaşkanı Abdullah Gül tarafından 14 Temmuz 2010 tarihinde Marmara Üniversitesi‘nin 7.rektörü olarak atandı.

Prof.Dr.Zafer Gül, evli ve iki çocuk babasıdır.