30 Kasım 1955 tarihinde Ankara’da doğdu. Prof. Dr. M. Şerif Baştav (tarihçi) ile İngilizce Öğretmeni Necla Baştav’ın oğlu, 1982 TED Ankara Koleji Mezunu Dr. Leyla Baştav’ın kardeşidir. 1966 yılında TED Ankara Koleji ilk kısmını bitirdikten sonra 1973 yılında aynı okulun lise kısmından mezun oldu. Aynı sene üniversite sınavlarına girerek ODTÜ Makine Mühendisliğini Türkiye dokuzuncusu olarak kazandı.

Daha sonra yeniden girdiği sınavlarla Hacettepe Tıp Fakültesine kaydını yaptıran Sencer Baştav, yarım kalan eğitimini daha sonra tamamlayarak 1984 senesinde ODTÜ İşletme Bölümünden Üniversite Diplomasını aldı. Sencer Baştav 9 Haziran 2011 tarihinde bir aydan beri tedavi görmekte olduğu Ankara Numune Hastanesinde vefat etmiştir.