1965 yılında İzmir’de doğdu. Orta okulu Özel Türk Lisesinde, Lise eğitimimi ise İzmir Atatürk Lisesinde bitirdikten sonra Ege Üniversitesi Tıp Fakültesinden 1990 yılında mezun oldu.

4 yıl süreyle pratisyen hekim olarak değişik yerlerde devlet hizmeti görevimi tamamladıktan sonra 1994 yılında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Deontoloji ve Tıp Tarihi Anabilim Dalında göreve başlayarak, 1998 yılında aynı bölümde Uzman, 1999 yılında ise Yardımcı Doçent unvanı aldı. 2010 yılında Tıp Tarihi ve Etik Anabilim Dalında Doçent oldu.

Akademik çalışma alanı olarak tıp tarihi ve tıp etiğini merkez alarak çeşitli toplantılara katıldı. Dr. Üstün’ün paramedikal ve medikal anlamda çeşitli dergilerde yayınlanmış 153 tane makalesi, Uluslararası dergilerde 6 makalesi, Ulusal dergilerde 33 makalesi, editörlüğü üstlendiği Tıbbiyeli (İyi İnsan-İyi Hekim) isimli bir kitabı mevcuttur.

Halen Ege Üniversitesi Tıp Fakültesindeki görevine devam etmektedir.

Üyesi olduğu dernekler:
Türk Tıp Tarihi Kurumu, Tıp Etiği ve Tıp Hukuku Derneği, Türkiye Biyoetik Derneği, Türk Tabipler Birliği İzmir Tabip Odası, Türk Kanser Araştırma ve Savaş Kurumu (İzmir Şubesi)

Yazarı Olduğu yada Editörü Olduğu Kitaplar:
1. Tıbbiyeli (İyi İnsan-İyi Hekim) Prof.Dr. Emin Faik Üstün, [Editör: Doç. Dr. Çağatay Üstün], Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Yayınları No:153, İzmir 2010. ISBN 975-483-466-06

2. Tıp Etiği Kavramlarına Giriş – Dr. Çağatay Üstün / Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Yayını:154, İzmir 2002. ISBN 975-483-539-X

3. Hekim, Tabip, Doktor – “Onlardan Anılar”, Editör: Dr. Çağatay Üstün / Dr. Eren Akçiçek, Dr. Fehmi Akçiçek, Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Yayınları No:155, İzmir 2003. ISBN 975-483-578-0

4. Tıp Sanatının Ustası Hippokrates, Dr. Çağatay Üstün, Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Yayınları No:156, İzmir 2003. ISBN 975-483-590-X

5. Gerçekler Bilinir Sırlar İse Asla, Dr. Çağatay Üstün, Ozan Yayıncılık/Babıali Kitaplığı, İstanbul, 2006. ISBN 975-6421-45-2