1918’de Afyonkarahisar‘ın Bolvadin ilçesinde doğdu. İlkokulu Bolvadin’de, liseyi Afyon’da bitirdi. 1942’de İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden mezun oldu. İki yıl pratisyen hekimlik ve iki buçuk yıl askerlikten sonra 1947’de Amerika’ya gitti. 1951’de İç Hastalıkları Uzmanı oldu.

1952’de Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi II. İç Hastalıkları Kliniği’nde Başasistan, 1956’da Doçent oldu. 1957’de Ege Üniversitesi’ne naklen atandı. 1961’de Profesör oldu.

Öğretim Üyeliği yanında; kürsü başkanlığı, yönetim kurulu, senato, üniversitelerarası kurul üyelikleri, rektör yardımcılığı ve dekanlık yaptı. 1979 yılında kendi isteği ile emekli oldu, serbest çalıştı.

20 Temmuz 1982’de Dokuz Eylül Üniversitesi’nin kuruluşu ile Rektör olarak atandı. 31 Temmuz 1987’de yaş haddi nedeniyle görevinden ayrıldı.

İngilizce ve Fransızca bilen Prof. Dr. Ömer Yiğitbaşı’nın, 21’i uluslararası tıp dergilerinde olmak üzere, toplam 214 bilimsel makalesi ve müşterek yazılmış iki tıp kitabı bulunmaktadır.

Evli ve iki çocuk babası olan Prof. Dr. Ömer Yiğitbaşı, 11 Mart 2006 tarihinde vefat etmiştir.