Kırşehir Kaman’da 1965 yılında doğan Şahin, evli ve 3 çocuk babası. Askerlik görevini Hakkari Çukurca’da yaptı. Şark hizmetimi Şemdinli’de İlçe Emniyet Amiri ve Hakkari’de şube müdürü olarak yaptı.  1987 yılında Polis Akademisinden mezun olduktan sonra İngilizce seviye ve becerilerinden dolayı kura dışı bırakılarak İnterpol Daire Başkanlığı’nda göreve alındı. Interpol Dairesi personeli olarak Fransa, Almanya ve Yunanistan’a kısa süreli görevler için gönderildi. 1988-1989 yıllarında ABD’de 1 yıl İngilizce ve mesleki eğitim kursuna katılan Şahin, 1989-1998 yıllarında İçişleri Bakanlığı ve Emniyet Genel Müdürlüğü’ne tercüman olarak katkıda bulundu, protokol konuşmaları hazırladı, İsveç, İtalya, Macaristan, İran ve Hindistan’da yapılan uluslararası toplantılara katıldı, ülke adına konuşmalarda bulundu.

İnterpol Dairesi personeli olarak Fransa, Almanya ve Yunanistan’a kısa süreli görevler için gönderilen Şahir; uluslararası terör, kaçakçılık, kalpazanlık konularında katıldığı toplantılarda, Türk polisi adına sunumlar yaptı. 1998–1999 yıllarında bir yıldan fazla BM Bosna Hersek görevinde bulundu, yerel ve uluslararası polislere eğitim veren Saraybosna Polis Eğitim Merkezi’nde hocalık yaptı, daha sonra bu merkezin müdürü (koordinatörü) oldu. Bu görevi sırasında Euro 2000 Avrupa Futbol Şampiyonasına katılan ülke polisleri için geçici olarak hazırlanan istihbarat merkezinde görev aldı. BM Kosova Polis Barış Gücü’ne katıldı. Uluslararası geçmiş tecrübelerinden dolayı Bölge Operasyon Merkezi’ne alındı. Daha sonra 5 ilin bağlı olduğu Prizren bölgesi bölge operasyon şefi yardımcılığına atandı. Bulunduğu bu pozisyonun öneminden dolayı buradaki görevi Emniyet Genel Müdürlüğü tarafından 2 defa uzatıldı.

2011 yılında Teftiş Kurulu Başkanlığı’na atanan Aksaray eski İl Emniyet Müdürü Halis Böğürcü’nün, yeniden eski görevine dönmesi üzerine bu görevde bulunan Mustafa Şahin, Eskişehir İl Emniyet Müdürlüğü görevine vekâleten atandı. Konya Ereğli Polis Meslek Yüksek Okulu Müdürü iken, 2011 yılında Aksaray İl Emniyet Müdürlüğü’ne atanan ve iki yıldır bu görevi sürdüren Şahin, önce Teftiş Kurulu Başkanlığı kadrosuna polis başmüfettişi olarak atandı. Şahin, bu atama sonrasında Eskişehir Emniyet Müdürlüğü görevine geçici görevle vekâleten atandı.