1963 yılında Aydın-Söke’de doğdu. Söke Lisesini 1980 yılında bitirdi. 1987 Anadolu Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden mezun oldu. 1996′ da İnönü Üniversitesinden Tıbbi Farmakoloji Uzmanlığı’nı aldı. 1997’de İnönü Üniversitesinde Yrd. Doç. olarak çalışmaya başladı. 1998’de Amerika Birleşik Devletlerine University of South Alabama’ya gitti. Altı ay süre ile kardiyak iskemi ve önkoşullama konularında Prof. Dr. James M. Downey ile çalıştı.

2000 yılında doçent oldu. 2001-2003 yılları arasında Amerika Birleşik Devletleri, Ulusal Teknoloji ve Standartlar Enstitüsünde Prof. Dr. Miral Dizdaroğlu ile DNA hasarı ve onarımı konularında çalıştı. Amerika’da bulunduğu sürede NIH’te klinik araştırmalar, klinik farmakoloji ve Çin bitkileri farmakolojisi konularında eğitim aldı. 2003 yılı sonunda Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Farmakoloji Anabilim Dalı’na atandı. 2004-2005 yılları arasında Türk Farmakoloji Derneği Yönetim Kurulu Üyeliğinde bulundu.

2006 yılında Profesör oldu. 2007’de Gazi Üniversitesi’nden Akupunktur eğitimi aldı. Ayrıca Sağlık Kurumları İşletmeciliği (Ön lisans) ve İşletme Fakültesi mezunu olan Prof. Dr. Mustafa Birincioğlu, 2003 yılından bu yana Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesinde Anabilim Dalı Başkanı olarak görev yapmaktadır. Temel ilgi alanları, kardiyovasküler farmakoloji, klinik araştırmalar, tamamlayıcı tıp ve akupunkturdur. SCI de yayınlanan dergilerdeki atıf sayısı 726, yayın başına atıf sayısı 18,62; H indeksi:13’dir.

Adnan Menderes Üniversitesi Rektörüdür.

Prof. Dr. Mustafa Birincioğlu evli ve iki çocuk babasıdır.