1952 yılında Üsküdar/İstanbul’da doğdu. 1970 yılında Deniz Harp Okulundan mezun olmuş, iki yıl subay olarak öğrenime devam ederek 1972 yılında Deniz Kuvvetleri Komutanlığında fiilen göreve başladı.

1978 yılına kadar Deniz Kuvvetlerine bağlı çeşitli gemilerde branş subaylığı yapan Koramiral Bilgel, 1980 yılında Deniz Harp Akademisinden mezun oldu.

1997 yılında Tuğamiralliğe, 2001 yılında Tümamiralliğe, 2005 yılında Koramiralliğe terfi etti eden Bilgel, 30 Ağustos 2009 tarihinden geçerli olarak Oramiralliğe terfi etmiş ve Donanma Komutanlığı görevine atanmıştır.

2011 yılı Yüksek Askeri Şûra toplantısının ardından Deniz Kuvvetleri Komutanı olarak atanmıştır.

Bayan Bahar Bilgel ile evli olan Koramiral Emin Murat Bilgel’in bir çocuğu vardır. İngilizce bilmektedir.